Имеет смысл обновить прошивку программатора если стоит 4.9,т.к. она не дружит с версиями программы начиная и выше 4.10. Но если нет желания считывать, то и она нормальная и стабильная.
Да не в периферии дело. Порт на проце дохнет, постоянное присутствие 3.3V (или отсутствие) такая схемотехника 8pin.Замена проца-решение, но для начала перепрошивка.