У меня такой-же USBDM как у вас (судя по версии), питание выставляется джамперами, НО - пока не включишь питание на вкладке Target VDD controll - чтение не работает.
Обрати внимание на высокоомные резисторы. Часто бывают в .... ну не то что-бы в обрыве, но сопротивление сильно уплывает. Пыль от щеток на модуле иногда мешает правильно детектировать сигналы.